Yugi Muto y sus amigos están en su último año de escuela secundaria y están hablando de lo que van a hacer en el futuro. Mientras tanto, Seto Kaiba ha encargado una excavación para recuperar el Rompecabezas del Milenio desensamblado de las ruinas de la cámara del Milenio. El Rompecabezas había albergado el alma de su rival, Atem, a quien Seto espera revivir el fin de retarlo a un duelo.